From 9f137b36348c7be576159929773fbc270d3be97e Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Florian Fischer <florian.fl.fischer@fau.de>
Date: Sun, 12 Feb 2017 11:37:12 +0100
Subject: add Sequenz Alignment

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 rcheatsheet.md | 7 +++++--
 1 file changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)

diff --git a/rcheatsheet.md b/rcheatsheet.md
index e0bcf12..fcc1d15 100644
--- a/rcheatsheet.md
+++ b/rcheatsheet.md
@@ -74,8 +74,11 @@
 
 | Befehl | Bedeutung |
 | --- | --- |
-| <c r></c> | |
-
+| <c r>readAAStringSet("Pfad/zu/Datei.fasta")</c> | Liest Sequenz aus Datei |
+| <c r>nchar(s)</c> | Liefert die Länge einer Sequenz |
+| <c r>pairwiseAlignment(seq1,seq2,substitutionMatrix=BLOSUM62,gapOpening=3,gapExtension=1)</c> | Liefert ein globales Alignment für seq1 und seq2 |
+| <c r>compareStrings(alignment)</c> | Stellt das Alignment graphisch dar |
+| <c r>nchar(alignment)</c> | Liefert die Länge des optimalen Alignment |
 <!--- damit pandoc syntax highlighting benutzt -->
 ```c++
 ```
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cgit v1.2.3